カレントテラピー 35-9 サンプル

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Current Therapy 2017 Vol.35 No.9 11乳癌ゲノム医療の臨床展開825tion sequencer:NGS)の進歩に伴い,全エクソン解析を低コストで提供することが可能となった.NGSを使用したBRCA1/2 変異陰性の家族性乳癌を対象とした研究において,乳癌発症と相関を示す複数のcommon variantが同定されている.この家族性乳癌グループのpolygenic risk scoreは散発性乳癌に比較し高いことが示されており,家族性乳癌の一部には,複数のリスクアレルによるpolygenic inheritanceに基づく症例が含まれていると考えられている.家族性乳癌の原因遺伝子は,BRCA 1 ,BRCA 2 ,TP 53,PTEN 等の高度発症リスク遺伝子,ATM ,CHEK2 ,PALB2 ,BRIP1 等の中等度発症リスク遺伝子,ゲノムワイド関連解析(genomewide association study:GWAS)から同定された低度発症リスク遺伝子に分類されるが,その頻度は高度発症リスク遺伝子による症例30%,中等度発症リスク遺伝子による症例5%,低度発症リスク遺伝子による症例14%,合計49%であり,家族性乳癌の半数以上の原因はいまだ不明であると報告されている(図1)16).BRCA 遺伝学検査は米国で1996年より臨床検査としてスタートしていたが,長らく特許により米国のMyriad Genetics社(以下,Myriad社)の1社からのみ全世界に提供されていた.年間25万人以上のBRCA 遺伝学的検査を施行し,莫大な数のBRCA 変異データを所有していた.しかし,2013年に“天然物である遺伝子には特許は無効である”という判決で米国におけるMyriad社のBRCA1/2 検査特許敗訴により,複数の検査会社が台頭し,BRCA1/2 単独の検査とコストはあまり変わらず,かつMyriad社のBRCA の豊富なデータベースに対抗すべくNGSの技術開発とともにさまざまな遺伝性乳癌に関連した遺伝子を含んだmulti -gene panelが登場した(表2).体細胞(癌組織)の遺伝子変異情報を利用して適切な薬剤を提供することは,従来の臨床病理基準に基づく治療選択より治療効果が高まることが示され,わが国においてもさまざまなクリニカルシークエンスが登場し,癌組織における複数の遺伝子異常の情報に基づき,治療薬の選択が開始されている.遺伝性腫瘍をターゲットとした生殖細胞系列遺伝学的検査においても,コンパニオン診断となり得ること,polygenicな病態が解明できること,費用も安いことから単一遺伝子(BRCA )だけを対象とした検査から複数の関連遺伝子を同時に検査するmulti-gene panelが海外では主流となっている.2 multi-gene panelの問題点しかし,multi-gene panelにはBRCA1/2 のような高い浸透率の遺伝子だけではなく,中~低浸透率や,浸透率が不明なものも含まれ,その遺伝子頻度,変異解釈,浸透率,適切な医学的管理,標的臓器も不明であることも多い.解釈が不明な遺伝子変化(variantof uncertain significance:VUS )が増加することなどが問題となっている.図2はMyriad社の25遺伝子を含む遺伝子パネル(現在は28遺伝子)を35,409人の乳癌患者に施行した結果である.病的variant(変Provider Test name URLMyriad Genetics Inc.My Risk(28 gene)https://myriad.com/products/myriskhereditary-cancer-panel/Ambry Genetics Various http://www.ambrygen.com/tests/breastnextUniversity of WashingtonBROCA(65 gene)http://tests.labmed.washington.edu/BROCAGene DX Various http://www.genedx.com/oncology-genetics/Emory Genetics Laboratory Various http://www.egl-eurofins.com/Invitae Various https://www.invitae.com/en/Baylor College of Medicine Varioushttps://www.bcm.edu/research/medicalgenetics-labs/tests.cfmJohns Hopkins University Various http://www.hopkinsmedicine.org/Color genomics 30 Gene Panel https://www.color.com/Counsyl Various https://www.counsyl.com/表2海外におけるMulti-gene panel検査(一部)Various:さまざまな組み合わせの遺伝子パネル検査が存在